在结束了文学部一行之后，真下真一的生活又回归日常。
每天上学下学，晚上睡网吧，平时吃饭都找东明报销。
在学校，日常的重心又放在了《嫌疑人X的献身》的更新上面，
这本书预定的字数是十五万字。
而在和上仓凉子接触后的第三天，这本书的字数终于来到了十一万字，故事的剧情也逐渐从平缓走向了高潮。
天才数学家石神和天才物理学家汤川的正面交锋正式拉开了序号。
两个高智商天才的对抗，以一种可怕而窒息的方式进行。
两人曾经是最好的朋友，而现在一人是超高智商犯罪者，一人是伽利略名侦探，
两人之间即不断回想着过往的友情，又不断面对面地试探对方的内心，关心与怀疑的情绪纠缠在双方的内心当中。
汤川拒绝了与警方的合作，而在雨夜中默然地寻找真相。
他每一次露出痛苦与折磨的表情，都是对于自己内心极大的煎熬。
石神设下的是一个无解的方程式，这让陆陆续续警方怀疑靖子（真正的凶手）、追求靖子的男人工藤，乃至石神。
但是警方始终只能在真相的外围敲敲打打，而没有寻找到到任何真正有用的关键信息。
因为，警方从始至终的动作都在石神的诱导下进行，就连读者所看到的真相也不过石神一手编制的“真相”。
从一开始，“真相”二字就已经被手法所替代了。
人们所看到的不过是一个完美的剧本罢了。
石神面对的是一个十分棘手的问题。
杀害丈夫的母女随时都有可能会露出破绽，而他没有任何的助手，他自己就是这对母女最后的希望。